Сопредседатель Партии народной свободы Борис Немцов назвал фильм "враньем от начала до конца" и "хамским передергиванием фактов". Он выразил уверенность в том, что этот фильм был сделан "за счет черной кассы Кремля". Лидер партии "Яблоко" Сергей Митрохин назвал "Анатомию протеста" примером государственной пропаганды и выразил мнение, что в ближайшие шесть лет Россия "будет эволюционировать в сторону жесткого тоталитаризма" с элементами пропаганды, свойственной периоду 30 годов прошлого века. Митрохин также назвал показанную по НТВ передачу свидетельством неуверенности и страха российских властей перед гражданским обществом.
Фильм "Анатомия протеста" был показан вечером 15 марта в рамках передачи "Чистосердечное признание". Его авторы, в частности, утверждали, что люди выходят на митинги "За честные выборы" за деньги. При этом самим оппозиционерам в фильме высказаться не дали, митинги комментировали исключительно их противники. Показ фильма "Анатомия протеста" вызвал шквал разгневанных откликов в социальных сетях Facebook и "В контакте", сообщает Lenta.ru.