Детей, 9-летних близнецов Николая и Анастасию, у Антоновой отняли в марте 2012 года по требованию ее бывшего мужа, гражданина Нидерландов. В 2010 году по просьбе отца детей помочь наладить с ними отношения социальные работники впервые посетили Антонову. Между тем отец близнецов попал в поле зрения полиции в связи с насилием против старшего сына Антоновой — Ильи.
Как позднее указала ответственная за права детей инстанция Нидерландов, для помещения Николая и Анастасии в интернат было две основные причины. Во-первых, Антонова с детьми дома общалась только на русском языке. Второй причиной стало предположение о том, что она может вместе с детьми вернуться в Латвию, несмотря на то, что официальный отец близнецов, с которым Елена уже несколько лет находится в разводе, проживает в Нидерландах.
