Отсчет допинговой эпопеи Веэрпалу берет отсчет с января 2011 года, когда проба спортсмена показала наличие допинга в его организме. По этой причине Веэрпалу не допустили до участия в проводимом в Осло чемпионате мира, а сам лыжник вскоре заявил об окончании спортивной карьеры по состоянию здоровья.
Только в апреле того же года о положительных пробах "А" и "В" Веэрпалу стало известно официально. При этом сам лыжник применение допинга отрицал, что не помешало Международной федерации лыжного спорта (FIS) летом 2011 года дисквалифицировать эстонского спортсмена на три года.
Спустя два года после начала всей этой истории CAS вынес оправдательный вердикт в пользу эстонского лыжника. Суд посчитал, что предельное значение теста на выявление гормона роста было рассмотрено неверно. При этом CAS отметил, что множество факторов свидетельствовало о применении Андрусом Веэрпалу препарата гормона роста. Однако процессуальные нарушения, допущенные Всемирным антидопинговым агентством (WADA) в ходе проведения анализа, а также обвинительное заключение FIS о нарушении антидопинговых правил эстонским спортсменом не могут быть поддержаны судом.
Теперь Международная федерация лыжного спорта (FIS) по требованию должна выплатить Веэрпалу компенсацию в размере 10 000 швейцарских франков на покрытие судебных издержек.
Андрус Веэрпалу дважды выигрывал золото Олимпийских игр (в Солт-Лейк-Сити-2002 и Турине-2006) на дистанции 15 км классическим стилем. Также является двукратным чемпионом мира (2001 и 2009 гг.), победитель шести этапов Кубка мира.
