Комиссарова получила перелом позвоночника со смещением во время тренировки 15 февраля в экстрим-парке "Роза Хутор", где готовилась к выступлению в дисциплине ски-кросса (спуск со склона с препятствиями) на Олимпиаде-2014 в Сочи. Спортсменка была отправлена на хирургическое лечение в Германию, а затем прошла реабилитацию в клинике доктора Блюма в испанской Марбелье.
Заключение о присвоении первой группы инвалидности сделали российские и немецкие врачи. Как заявил директор Федерации фристайла России (ФФР) Сергей Король, полностью восстановить позвоночник спортсменки невозможно. Спинной мозг Комиссаровой поврежден с 12-го позвонка и перестал функционировать уже в первый день после травмы из-за отека.
Нижняя часть тела фристайлистки остается парализованной, а одним из критериев установления первой группы инвалидности является неспособность к самостоятельному передвижению. Правительство Санкт-Петербурга, который Комиссарова представляла на соревнованиях, выделило ей специально оборудованную квартиру, автомобиль и подготовило несколько клиник. Есть, по словам Короля, у Марии и предложения по работе: ее готовы взять на службу в Паралимпийский комитет России и департамент Санкт-Петербурга по спорту.