Сейчас специалисты рассматривают вариант физического сбоя или короткого замыкания в системе питания "Фобос-Грунта". По словам источника в ракетно-космической отрасли России, есть и "другие варианты, один из которых связан с внешним воздействием на станцию".
Существует версия, что станция могла оказаться в зоне действия американского радара, установленного на атолле Кваджалейн (Маршалловы острова), который на тот момент отслеживал траекторию одного из астероидов. Вследствие чего под воздействием мегаваттного импульса произошел сбой в электронике. После она уже не смогла выдать команду на включение двигательной установки "Фобоса". Конкретный тип радара при этом назван не был.
Как сообщалось, научная станция успешно стартовала с Байконура 9 ноября. Ракета-носитель "Зенит" вывела "Фобос-грунт" на низкую околоземную орбиту с перигеем 207 и апогеем 348 км, раскрылись солнечные батареи, затем должна была включиться маршевая двигательная установка для перехода станции с опорной орбиты на гиперболическую отлетную траекторию. Но вместо того чтобы взять курс на Марс, "Фобос-грунт" завис на опорной орбите.
Попытки наладить связь со станции, которые в итоге закончились неудачно. "Фобос" исчез с экранов радаров войск воздушно-космической обороны России вечером 15 января. Факт падения останков "Фобоса" подтвердили в Европейском космическом агентстве и в Командовании воздушно-космической обороны Северной Америки, однако но точных данных о возможном месте падения нет.
Согласно данным войск космической обороны России, все произошло в акватории Тихого океана в 1250 км от острова Веллингтон (Чили). Но в Роскосмосе заявили, что расчетная точка окончательного разрушения станции — примерно в 10 км над поверхностью Земли над территорией Бразилии.