Рыцарским крестом ордена "За заслуги перед Литвой" Палецкис был награжден 21 апреля 2004 года "за установление и развитие связей Вильнюса с западной Европой". Награду ему вручил временно исполняющий обязанности президента, спикер парламента Артурас Паулаускас.
Палецкис в интервью изданию "ВЗГЛЯД" заявил, что "с удовольствием" вернет орден 11 марта, в день восстановления независимости республики. "Я хочу показать публично, что это абсурд", — подчеркнул Палецкис, добавив, что теперь у него будет "меньше связей с системой, которая довела Литву в экономическом плане до ручки".
Палецкис был привлечен к уголовной ответственности за то, что в 2010 году он заявил СМИ, что 13 января 1991 года "свои стреляли в своих".
Решение по резонансному "делу Палецкиса" суд принял летом 2012 года. Социалисту были предъявлены обвинения по статье "Об отрицании советской оккупации" за его высказывание о январских событиях 1991 года (когда более 10 человек погибли при штурме вильнюсской телебашни).
Суд первой инстанции оправдал политика, однако прокуратура обжаловала приговор и добилась обвинительного решения: Вильнюсский окружной суд в признал Палецкиса виновным и назначил ему штраф в размере 80 минимальных прожиточных минимумов или 10 400 литов (около 2120 латов).
Лидер Социалистического народного фронта обжаловал это решение, но Верховный суд Литвы его жалобу отклонил, признав его виновным в тяжких преступлений СССР, совершенных против жителей Литвы, а также за оскорбление памяти людей, погибших и пострадавших в борьбе за восстановление независимости и их близких.